Система китообразных разработана еще недостаточно. Как указано, даже
целостность всего отряда некоторыми ставится под сомнение. Объемы некоторых
семейств и подсемейств также не установлены окончательно.
Обычно в отряде китообразных выделяется 3 подотряда: современных зубатых -
Odontoceti Flower и усатых - Mysticeti Flower китов и ископаемых Archaeoceti
Flower. В отряде обычно принимается 16 семейств и 173 рода).
Общее число современных видов отряда около 81. В России встречаются
представители 6 современных семейств, 19 родов (примерно 52% мировой фауны) и 23
видов(примерно 28% мировой фауны). Подотряд Archaeoceti объединяет 3 семейства:
Protocetidae Stromer (средний миоцен), Doridontidae Miller (эоцен, миоцен) и
Basilosauridae Соре (эоцен, олигоцен) - и 14 родов. Семейство Protocetidae
включало как короткотелые формы, например Protocetus с длиной не более 2,5 м,
так и длиннотелые (у имеющего удлиненные позвонки Eocetus только череп в длину
достигал 120 см). По-видимому, от Eocetus берут начало представители семейства
Basilosauridae, а от Protocetus и Pappocetus - представители Doridontidae. К
семейству Doridontidae принадлежат животные длиной 8 - 9 м с удлиненным и гибким
шейным отделом и пилообразными щечными зубами, а к семейству Basilosauridae -
длиной 8 - 22 м с некоторыми признаками скелета, достигающими высшей ступени
развития в пределах подотряда.